İnsanlık uygarlığı okyanusların altında yeniden kurdu, ancak derinlikler şimdiden sahiplenilmiş durumda. İnsanları kendi dünyasına tehdit olarak gören uzaylı tür Othryx bir su altı şehrini yok edince, Birleşik Denizaltı Ulusları en gelişmiş savaş gemisini, Deep Sea Cruiser Ryujin’i göreve gönderir. Mürettebatı, bu savaşın hayatta kalma mücadelesi mi yoksa hâlâ durdurulabilecek bir çatışma mı olduğunu ortaya çıkarırken güçlü bir düşmanla yüzleşmek zorundadır.